Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2C6

Upk1b, Uroplakin-1b, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk1bQ9Z2C6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upk1bQ9Z2C6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upk1bQ9Z2C6 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upk1bQ9Z2C6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Upk1bQ9Z2C6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upk1bQ9Z2C6 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upk1bQ9Z2C6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upk1bQ9Z2C6 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upk1bQ9Z2C6 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upk1bQ9Z2C6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upk1bQ9Z2C6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upk1bQ9Z2C6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Upk1bQ9Z2C6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upk1bQ9Z2C6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Upk1bQ9Z2C6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upk1bQ9Z2C6 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upk1bQ9Z2C6 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upk1bQ9Z2C6 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upk1bQ9Z2C6 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upk1bQ9Z2C6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upk1bQ9Z2C6 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upk1bQ9Z2C6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upk1bQ9Z2C6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Upk1bQ9Z2C6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upk1bQ9Z2C6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Upk1bQ9Z2C6 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Upk1bQ9Z2C6 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Upk1bQ9Z2C6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Upk1bQ9Z2C6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Upk1bQ9Z2C6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Upk1bQ9Z2C6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Upk1bQ9Z2C6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Upk1bQ9Z2C6 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Upk1bQ9Z2C6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Upk1bQ9Z2C6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Upk1bQ9Z2C6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Upk1bQ9Z2C6 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Upk1bQ9Z2C6 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Upk1bQ9Z2C6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Upk1bQ9Z2C6 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Upk1bQ9Z2C6 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Upk1bQ9Z2C6 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upk1bQ9Z2C6 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upk1bQ9Z2C6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upk1bQ9Z2C6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upk1bQ9Z2C6 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upk1bQ9Z2C6 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upk1bQ9Z2C6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upk1bQ9Z2C6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upk1bQ9Z2C6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Upk1bQ9Z2C6 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upk1bQ9Z2C6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upk1bQ9Z2C6 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upk1bQ9Z2C6 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Upk1bQ9Z2C6 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upk1bQ9Z2C6 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upk1bQ9Z2C6 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upk1bQ9Z2C6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upk1bQ9Z2C6 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upk1bQ9Z2C6 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upk1bQ9Z2C6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk1bQ9Z2C6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk1bQ9Z2C6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk1bQ9Z2C6 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk1bQ9Z2C6 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk1bQ9Z2C6 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk1bQ9Z2C6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk1bQ9Z2C6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk1bQ9Z2C6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk1bQ9Z2C6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk1bQ9Z2C6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk1bQ9Z2C6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk1bQ9Z2C6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk1bQ9Z2C6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk1bQ9Z2C6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk1bQ9Z2C6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk1bQ9Z2C6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk1bQ9Z2C6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk1bQ9Z2C6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk1bQ9Z2C6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk1bQ9Z2C6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk1bQ9Z2C6 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk1bQ9Z2C6 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk1bQ9Z2C6 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk1bQ9Z2C6 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Upk1bQ9Z2C6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Upk1bQ9Z2C6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Upk1bQ9Z2C6 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Upk1bQ9Z2C6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Upk1bQ9Z2C6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Upk1bQ9Z2C6 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Upk1bQ9Z2C6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Upk1bQ9Z2C6 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Upk1bQ9Z2C6 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Upk1bQ9Z2C6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Upk1bQ9Z2C6 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Upk1bQ9Z2C6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Upk1bQ9Z2C6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Upk1bQ9Z2C6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Upk1bQ9Z2C6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms