Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z160

Cog1, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog1Q9Z160 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Cog1Q9Z160 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cog1Q9Z160 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cog1Q9Z160 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cog1Q9Z160 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cog1Q9Z160 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cog1Q9Z160 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cog1Q9Z160 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cog1Q9Z160 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cog1Q9Z160 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cog1Q9Z160 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cog1Q9Z160 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cog1Q9Z160 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cog1Q9Z160 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cog1Q9Z160 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cog1Q9Z160 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cog1Q9Z160 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cog1Q9Z160 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cog1Q9Z160 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cog1Q9Z160 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cog1Q9Z160 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cog1Q9Z160 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cog1Q9Z160 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cog1Q9Z160 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cog1Q9Z160 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cog1Q9Z160 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cog1Q9Z160 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cog1Q9Z160 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cog1Q9Z160 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cog1Q9Z160 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cog1Q9Z160 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cog1Q9Z160 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cog1Q9Z160 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Cog1Q9Z160 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cog1Q9Z160 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cog1Q9Z160 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cog1Q9Z160 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cog1Q9Z160 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cog1Q9Z160 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cog1Q9Z160 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cog1Q9Z160 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cog1Q9Z160 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cog1Q9Z160 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cog1Q9Z160 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cog1Q9Z160 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cog1Q9Z160 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cog1Q9Z160 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cog1Q9Z160 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cog1Q9Z160 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cog1Q9Z160 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cog1Q9Z160 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cog1Q9Z160 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cog1Q9Z160 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cog1Q9Z160 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cog1Q9Z160 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cog1Q9Z160 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cog1Q9Z160 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cog1Q9Z160 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cog1Q9Z160 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cog1Q9Z160 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cog1Q9Z160 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cog1Q9Z160 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cog1Q9Z160 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cog1Q9Z160 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cog1Q9Z160 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cog1Q9Z160 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cog1Q9Z160 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cog1Q9Z160 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cog1Q9Z160 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cog1Q9Z160 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cog1Q9Z160 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cog1Q9Z160 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cog1Q9Z160 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cog1Q9Z160 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cog1Q9Z160 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cog1Q9Z160 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cog1Q9Z160 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cog1Q9Z160 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cog1Q9Z160 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cog1Q9Z160 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms