Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMED7Q9Y3B3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms