Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC3

Msrb1, Methionine-R-sulfoxide reductase B1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msrb1Q9JLC3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Msrb1Q9JLC3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Msrb1Q9JLC3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Msrb1Q9JLC3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Msrb1Q9JLC3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Msrb1Q9JLC3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Msrb1Q9JLC3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Msrb1Q9JLC3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Msrb1Q9JLC3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Msrb1Q9JLC3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Msrb1Q9JLC3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Msrb1Q9JLC3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Msrb1Q9JLC3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Msrb1Q9JLC3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Msrb1Q9JLC3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Msrb1Q9JLC3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Msrb1Q9JLC3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Msrb1Q9JLC3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Msrb1Q9JLC3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Msrb1Q9JLC3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Msrb1Q9JLC3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Msrb1Q9JLC3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Msrb1Q9JLC3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Msrb1Q9JLC3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Msrb1Q9JLC3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Msrb1Q9JLC3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Msrb1Q9JLC3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Msrb1Q9JLC3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Msrb1Q9JLC3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Msrb1Q9JLC3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Msrb1Q9JLC3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Msrb1Q9JLC3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Msrb1Q9JLC3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Msrb1Q9JLC3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Msrb1Q9JLC3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Msrb1Q9JLC3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Msrb1Q9JLC3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Msrb1Q9JLC3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Msrb1Q9JLC3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Msrb1Q9JLC3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Msrb1Q9JLC3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Msrb1Q9JLC3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msrb1Q9JLC3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msrb1Q9JLC3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msrb1Q9JLC3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msrb1Q9JLC3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msrb1Q9JLC3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msrb1Q9JLC3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msrb1Q9JLC3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msrb1Q9JLC3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msrb1Q9JLC3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msrb1Q9JLC3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msrb1Q9JLC3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msrb1Q9JLC3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msrb1Q9JLC3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msrb1Q9JLC3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msrb1Q9JLC3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msrb1Q9JLC3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msrb1Q9JLC3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msrb1Q9JLC3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msrb1Q9JLC3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Msrb1Q9JLC3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msrb1Q9JLC3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msrb1Q9JLC3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msrb1Q9JLC3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msrb1Q9JLC3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msrb1Q9JLC3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msrb1Q9JLC3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msrb1Q9JLC3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msrb1Q9JLC3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msrb1Q9JLC3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msrb1Q9JLC3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msrb1Q9JLC3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Msrb1Q9JLC3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Msrb1Q9JLC3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Msrb1Q9JLC3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Msrb1Q9JLC3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Msrb1Q9JLC3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Msrb1Q9JLC3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Msrb1Q9JLC3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Msrb1Q9JLC3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Msrb1Q9JLC3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Msrb1Q9JLC3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Msrb1Q9JLC3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Msrb1Q9JLC3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Msrb1Q9JLC3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Msrb1Q9JLC3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Msrb1Q9JLC3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Msrb1Q9JLC3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Msrb1Q9JLC3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Msrb1Q9JLC3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Msrb1Q9JLC3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Msrb1Q9JLC3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Msrb1Q9JLC3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Msrb1Q9JLC3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Msrb1Q9JLC3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Msrb1Q9JLC3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Msrb1Q9JLC3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Msrb1Q9JLC3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Msrb1Q9JLC3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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