Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKZ2

Slc5a3, Sodium/myo-inositol cotransporter, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a3Q9JKZ2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Slc5a3Q9JKZ2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Slc5a3Q9JKZ2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Slc5a3Q9JKZ2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Slc5a3Q9JKZ2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Slc5a3Q9JKZ2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc5a3Q9JKZ2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc5a3Q9JKZ2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc5a3Q9JKZ2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc5a3Q9JKZ2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc5a3Q9JKZ2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc5a3Q9JKZ2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc5a3Q9JKZ2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc5a3Q9JKZ2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc5a3Q9JKZ2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc5a3Q9JKZ2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc5a3Q9JKZ2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc5a3Q9JKZ2 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc5a3Q9JKZ2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc5a3Q9JKZ2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc5a3Q9JKZ2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc5a3Q9JKZ2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc5a3Q9JKZ2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc5a3Q9JKZ2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc5a3Q9JKZ2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc5a3Q9JKZ2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc5a3Q9JKZ2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc5a3Q9JKZ2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc5a3Q9JKZ2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc5a3Q9JKZ2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc5a3Q9JKZ2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc5a3Q9JKZ2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc5a3Q9JKZ2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc5a3Q9JKZ2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc5a3Q9JKZ2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc5a3Q9JKZ2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc5a3Q9JKZ2 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc5a3Q9JKZ2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc5a3Q9JKZ2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc5a3Q9JKZ2 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc5a3Q9JKZ2 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc5a3Q9JKZ2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc5a3Q9JKZ2 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc5a3Q9JKZ2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc5a3Q9JKZ2 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc5a3Q9JKZ2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc5a3Q9JKZ2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc5a3Q9JKZ2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc5a3Q9JKZ2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc5a3Q9JKZ2 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc5a3Q9JKZ2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc5a3Q9JKZ2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc5a3Q9JKZ2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc5a3Q9JKZ2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc5a3Q9JKZ2 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc5a3Q9JKZ2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc5a3Q9JKZ2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc5a3Q9JKZ2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc5a3Q9JKZ2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc5a3Q9JKZ2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc5a3Q9JKZ2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc5a3Q9JKZ2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc5a3Q9JKZ2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc5a3Q9JKZ2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc5a3Q9JKZ2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc5a3Q9JKZ2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc5a3Q9JKZ2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc5a3Q9JKZ2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc5a3Q9JKZ2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc5a3Q9JKZ2 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc5a3Q9JKZ2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc5a3Q9JKZ2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc5a3Q9JKZ2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc5a3Q9JKZ2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc5a3Q9JKZ2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc5a3Q9JKZ2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc5a3Q9JKZ2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc5a3Q9JKZ2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc5a3Q9JKZ2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc5a3Q9JKZ2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc5a3Q9JKZ2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc5a3Q9JKZ2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc5a3Q9JKZ2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc5a3Q9JKZ2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc5a3Q9JKZ2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc5a3Q9JKZ2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc5a3Q9JKZ2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc5a3Q9JKZ2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc5a3Q9JKZ2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc5a3Q9JKZ2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc5a3Q9JKZ2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc5a3Q9JKZ2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc5a3Q9JKZ2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc5a3Q9JKZ2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc5a3Q9JKZ2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc5a3Q9JKZ2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc5a3Q9JKZ2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc5a3Q9JKZ2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc5a3Q9JKZ2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc5a3Q9JKZ2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms