Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stx6Q9JKK1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Stx6Q9JKK1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stx6Q9JKK1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stx6Q9JKK1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Stx6Q9JKK1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Stx6Q9JKK1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stx6Q9JKK1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stx6Q9JKK1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stx6Q9JKK1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stx6Q9JKK1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stx6Q9JKK1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stx6Q9JKK1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stx6Q9JKK1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stx6Q9JKK1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stx6Q9JKK1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stx6Q9JKK1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stx6Q9JKK1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stx6Q9JKK1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Stx6Q9JKK1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stx6Q9JKK1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stx6Q9JKK1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stx6Q9JKK1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Stx6Q9JKK1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Stx6Q9JKK1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Stx6Q9JKK1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stx6Q9JKK1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stx6Q9JKK1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stx6Q9JKK1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx6Q9JKK1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx6Q9JKK1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx6Q9JKK1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx6Q9JKK1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx6Q9JKK1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx6Q9JKK1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx6Q9JKK1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx6Q9JKK1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx6Q9JKK1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx6Q9JKK1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx6Q9JKK1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx6Q9JKK1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx6Q9JKK1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx6Q9JKK1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx6Q9JKK1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx6Q9JKK1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx6Q9JKK1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx6Q9JKK1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx6Q9JKK1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx6Q9JKK1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx6Q9JKK1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx6Q9JKK1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx6Q9JKK1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx6Q9JKK1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx6Q9JKK1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx6Q9JKK1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx6Q9JKK1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx6Q9JKK1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx6Q9JKK1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx6Q9JKK1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx6Q9JKK1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx6Q9JKK1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx6Q9JKK1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx6Q9JKK1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx6Q9JKK1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx6Q9JKK1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx6Q9JKK1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx6Q9JKK1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx6Q9JKK1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx6Q9JKK1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx6Q9JKK1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx6Q9JKK1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx6Q9JKK1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx6Q9JKK1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx6Q9JKK1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx6Q9JKK1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stx6Q9JKK1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stx6Q9JKK1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stx6Q9JKK1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stx6Q9JKK1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stx6Q9JKK1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stx6Q9JKK1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stx6Q9JKK1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stx6Q9JKK1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stx6Q9JKK1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stx6Q9JKK1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stx6Q9JKK1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stx6Q9JKK1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stx6Q9JKK1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Stx6Q9JKK1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stx6Q9JKK1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms