Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Dap3Q9ER88 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms