Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQZ6

Rapgef4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef4Q9EQZ6 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rapgef4Q9EQZ6 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Rapgef4Q9EQZ6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rapgef4Q9EQZ6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rapgef4Q9EQZ6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rapgef4Q9EQZ6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rapgef4Q9EQZ6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rapgef4Q9EQZ6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rapgef4Q9EQZ6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rapgef4Q9EQZ6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rapgef4Q9EQZ6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rapgef4Q9EQZ6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rapgef4Q9EQZ6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rapgef4Q9EQZ6 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rapgef4Q9EQZ6 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rapgef4Q9EQZ6 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rapgef4Q9EQZ6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rapgef4Q9EQZ6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rapgef4Q9EQZ6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rapgef4Q9EQZ6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rapgef4Q9EQZ6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rapgef4Q9EQZ6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rapgef4Q9EQZ6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rapgef4Q9EQZ6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rapgef4Q9EQZ6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rapgef4Q9EQZ6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Rapgef4Q9EQZ6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rapgef4Q9EQZ6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rapgef4Q9EQZ6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rapgef4Q9EQZ6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rapgef4Q9EQZ6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rapgef4Q9EQZ6 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rapgef4Q9EQZ6 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rapgef4Q9EQZ6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rapgef4Q9EQZ6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rapgef4Q9EQZ6 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rapgef4Q9EQZ6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rapgef4Q9EQZ6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rapgef4Q9EQZ6 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rapgef4Q9EQZ6 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rapgef4Q9EQZ6 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rapgef4Q9EQZ6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rapgef4Q9EQZ6 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rapgef4Q9EQZ6 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rapgef4Q9EQZ6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rapgef4Q9EQZ6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rapgef4Q9EQZ6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rapgef4Q9EQZ6 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Rapgef4Q9EQZ6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rapgef4Q9EQZ6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rapgef4Q9EQZ6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rapgef4Q9EQZ6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rapgef4Q9EQZ6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rapgef4Q9EQZ6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rapgef4Q9EQZ6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rapgef4Q9EQZ6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rapgef4Q9EQZ6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rapgef4Q9EQZ6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rapgef4Q9EQZ6 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rapgef4Q9EQZ6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rapgef4Q9EQZ6 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rapgef4Q9EQZ6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rapgef4Q9EQZ6 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rapgef4Q9EQZ6 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rapgef4Q9EQZ6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rapgef4Q9EQZ6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rapgef4Q9EQZ6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rapgef4Q9EQZ6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rapgef4Q9EQZ6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rapgef4Q9EQZ6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rapgef4Q9EQZ6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rapgef4Q9EQZ6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rapgef4Q9EQZ6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rapgef4Q9EQZ6 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rapgef4Q9EQZ6 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rapgef4Q9EQZ6 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Rapgef4Q9EQZ6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rapgef4Q9EQZ6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rapgef4Q9EQZ6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rapgef4Q9EQZ6 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rapgef4Q9EQZ6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rapgef4Q9EQZ6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rapgef4Q9EQZ6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rapgef4Q9EQZ6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rapgef4Q9EQZ6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rapgef4Q9EQZ6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rapgef4Q9EQZ6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rapgef4Q9EQZ6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rapgef4Q9EQZ6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rapgef4Q9EQZ6 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rapgef4Q9EQZ6 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rapgef4Q9EQZ6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rapgef4Q9EQZ6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rapgef4Q9EQZ6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rapgef4Q9EQZ6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rapgef4Q9EQZ6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rapgef4Q9EQZ6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rapgef4Q9EQZ6 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rapgef4Q9EQZ6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rapgef4Q9EQZ6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms