Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnft1Q9DCN7 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnft1Q9DCN7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnft1Q9DCN7 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rnft1Q9DCN7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rnft1Q9DCN7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rnft1Q9DCN7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rnft1Q9DCN7 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnft1Q9DCN7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnft1Q9DCN7 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnft1Q9DCN7 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnft1Q9DCN7 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnft1Q9DCN7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnft1Q9DCN7 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnft1Q9DCN7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnft1Q9DCN7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnft1Q9DCN7 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnft1Q9DCN7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnft1Q9DCN7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnft1Q9DCN7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnft1Q9DCN7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnft1Q9DCN7 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnft1Q9DCN7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnft1Q9DCN7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnft1Q9DCN7 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnft1Q9DCN7 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnft1Q9DCN7 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnft1Q9DCN7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnft1Q9DCN7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnft1Q9DCN7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnft1Q9DCN7 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnft1Q9DCN7 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnft1Q9DCN7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnft1Q9DCN7 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnft1Q9DCN7 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnft1Q9DCN7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnft1Q9DCN7 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnft1Q9DCN7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnft1Q9DCN7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnft1Q9DCN7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnft1Q9DCN7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnft1Q9DCN7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnft1Q9DCN7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnft1Q9DCN7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnft1Q9DCN7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnft1Q9DCN7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnft1Q9DCN7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnft1Q9DCN7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnft1Q9DCN7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnft1Q9DCN7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnft1Q9DCN7 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnft1Q9DCN7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnft1Q9DCN7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnft1Q9DCN7 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnft1Q9DCN7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnft1Q9DCN7 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnft1Q9DCN7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnft1Q9DCN7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnft1Q9DCN7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnft1Q9DCN7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnft1Q9DCN7 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnft1Q9DCN7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnft1Q9DCN7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnft1Q9DCN7 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnft1Q9DCN7 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnft1Q9DCN7 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnft1Q9DCN7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnft1Q9DCN7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnft1Q9DCN7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnft1Q9DCN7 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnft1Q9DCN7 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnft1Q9DCN7 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnft1Q9DCN7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnft1Q9DCN7 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnft1Q9DCN7 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnft1Q9DCN7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnft1Q9DCN7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnft1Q9DCN7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnft1Q9DCN7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnft1Q9DCN7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnft1Q9DCN7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnft1Q9DCN7 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnft1Q9DCN7 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnft1Q9DCN7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnft1Q9DCN7 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnft1Q9DCN7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnft1Q9DCN7 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnft1Q9DCN7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnft1Q9DCN7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnft1Q9DCN7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnft1Q9DCN7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnft1Q9DCN7 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnft1Q9DCN7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnft1Q9DCN7 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnft1Q9DCN7 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnft1Q9DCN7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnft1Q9DCN7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnft1Q9DCN7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnft1Q9DCN7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnft1Q9DCN7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms