Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL0

Smim23, Small integral membrane protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim23Q9DAL0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smim23Q9DAL0 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smim23Q9DAL0 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smim23Q9DAL0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smim23Q9DAL0 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smim23Q9DAL0 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms