Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N1

Uncharacterized protein C11orf24 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8N1 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D8N1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9D8N1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D8N1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D8N1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D8N1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D8N1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D8N1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D8N1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms