Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms