Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms