Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

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Length 313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Snx20Q9D2Y5 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
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Snx20Q9D2Y5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Snx20Q9D2Y5 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Snx20Q9D2Y5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Snx20Q9D2Y5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Snx20Q9D2Y5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx20Q9D2Y5 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx20Q9D2Y5 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx20Q9D2Y5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx20Q9D2Y5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Snx20Q9D2Y5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Snx20Q9D2Y5 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx20Q9D2Y5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx20Q9D2Y5 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx20Q9D2Y5 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Snx20Q9D2Y5 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Snx20Q9D2Y5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms