Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl28Q9D1B9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl28Q9D1B9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl28Q9D1B9 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl28Q9D1B9 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl28Q9D1B9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl28Q9D1B9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl28Q9D1B9 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl28Q9D1B9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl28Q9D1B9 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl28Q9D1B9 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl28Q9D1B9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl28Q9D1B9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl28Q9D1B9 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl28Q9D1B9 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl28Q9D1B9 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl28Q9D1B9 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl28Q9D1B9 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl28Q9D1B9 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl28Q9D1B9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl28Q9D1B9 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl28Q9D1B9 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl28Q9D1B9 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl28Q9D1B9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl28Q9D1B9 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl28Q9D1B9 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl28Q9D1B9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl28Q9D1B9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl28Q9D1B9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl28Q9D1B9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl28Q9D1B9 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl28Q9D1B9 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl28Q9D1B9 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl28Q9D1B9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl28Q9D1B9 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl28Q9D1B9 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl28Q9D1B9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl28Q9D1B9 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl28Q9D1B9 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl28Q9D1B9 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl28Q9D1B9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl28Q9D1B9 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl28Q9D1B9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl28Q9D1B9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl28Q9D1B9 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl28Q9D1B9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl28Q9D1B9 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl28Q9D1B9 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl28Q9D1B9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Mrpl28Q9D1B9 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mrpl28Q9D1B9 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Mrpl28Q9D1B9 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
Mrpl28Q9D1B9 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl28Q9D1B9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl28Q9D1B9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl28Q9D1B9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl28Q9D1B9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl28Q9D1B9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl28Q9D1B9 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl28Q9D1B9 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl28Q9D1B9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl28Q9D1B9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl28Q9D1B9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl28Q9D1B9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl28Q9D1B9 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl28Q9D1B9 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl28Q9D1B9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl28Q9D1B9 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl28Q9D1B9 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl28Q9D1B9 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl28Q9D1B9 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl28Q9D1B9 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl28Q9D1B9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl28Q9D1B9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl28Q9D1B9 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl28Q9D1B9 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl28Q9D1B9 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl28Q9D1B9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl28Q9D1B9 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl28Q9D1B9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms