Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ70

3110001I22Rik, MCG129801, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3110001I22RikQ9CZ70 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms