Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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