Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX34

Sugt1, Protein SGT1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sugt1Q9CX34 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sugt1Q9CX34 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sugt1Q9CX34 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sugt1Q9CX34 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sugt1Q9CX34 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sugt1Q9CX34 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sugt1Q9CX34 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sugt1Q9CX34 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sugt1Q9CX34 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sugt1Q9CX34 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sugt1Q9CX34 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sugt1Q9CX34 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sugt1Q9CX34 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sugt1Q9CX34 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sugt1Q9CX34 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Sugt1Q9CX34 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sugt1Q9CX34 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sugt1Q9CX34 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sugt1Q9CX34 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sugt1Q9CX34 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sugt1Q9CX34 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sugt1Q9CX34 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sugt1Q9CX34 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sugt1Q9CX34 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sugt1Q9CX34 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sugt1Q9CX34 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sugt1Q9CX34 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sugt1Q9CX34 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sugt1Q9CX34 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sugt1Q9CX34 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sugt1Q9CX34 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sugt1Q9CX34 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sugt1Q9CX34 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sugt1Q9CX34 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sugt1Q9CX34 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sugt1Q9CX34 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sugt1Q9CX34 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sugt1Q9CX34 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sugt1Q9CX34 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sugt1Q9CX34 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sugt1Q9CX34 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sugt1Q9CX34 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sugt1Q9CX34 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sugt1Q9CX34 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sugt1Q9CX34 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sugt1Q9CX34 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sugt1Q9CX34 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sugt1Q9CX34 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sugt1Q9CX34 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sugt1Q9CX34 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sugt1Q9CX34 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sugt1Q9CX34 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sugt1Q9CX34 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sugt1Q9CX34 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sugt1Q9CX34 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sugt1Q9CX34 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sugt1Q9CX34 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sugt1Q9CX34 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sugt1Q9CX34 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sugt1Q9CX34 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sugt1Q9CX34 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sugt1Q9CX34 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sugt1Q9CX34 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sugt1Q9CX34 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sugt1Q9CX34 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sugt1Q9CX34 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sugt1Q9CX34 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sugt1Q9CX34 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sugt1Q9CX34 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sugt1Q9CX34 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sugt1Q9CX34 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sugt1Q9CX34 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sugt1Q9CX34 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sugt1Q9CX34 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sugt1Q9CX34 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sugt1Q9CX34 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sugt1Q9CX34 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sugt1Q9CX34 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sugt1Q9CX34 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sugt1Q9CX34 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sugt1Q9CX34 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sugt1Q9CX34 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sugt1Q9CX34 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sugt1Q9CX34 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sugt1Q9CX34 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sugt1Q9CX34 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sugt1Q9CX34 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sugt1Q9CX34 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sugt1Q9CX34 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sugt1Q9CX34 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sugt1Q9CX34 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sugt1Q9CX34 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sugt1Q9CX34 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sugt1Q9CX34 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sugt1Q9CX34 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sugt1Q9CX34 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sugt1Q9CX34 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sugt1Q9CX34 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sugt1Q9CX34 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sugt1Q9CX34 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms