Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cxxc1Q9CWW7 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cxxc1Q9CWW7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cxxc1Q9CWW7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cxxc1Q9CWW7 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cxxc1Q9CWW7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cxxc1Q9CWW7 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cxxc1Q9CWW7 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cxxc1Q9CWW7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cxxc1Q9CWW7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cxxc1Q9CWW7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cxxc1Q9CWW7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cxxc1Q9CWW7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cxxc1Q9CWW7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cxxc1Q9CWW7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cxxc1Q9CWW7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms