Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms