Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT1

Gatb, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GatbQ99JT1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GatbQ99JT1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GatbQ99JT1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GatbQ99JT1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GatbQ99JT1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GatbQ99JT1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GatbQ99JT1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GatbQ99JT1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GatbQ99JT1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GatbQ99JT1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GatbQ99JT1 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GatbQ99JT1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GatbQ99JT1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GatbQ99JT1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GatbQ99JT1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GatbQ99JT1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GatbQ99JT1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GatbQ99JT1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GatbQ99JT1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GatbQ99JT1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GatbQ99JT1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GatbQ99JT1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GatbQ99JT1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GatbQ99JT1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GatbQ99JT1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GatbQ99JT1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GatbQ99JT1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GatbQ99JT1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GatbQ99JT1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GatbQ99JT1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GatbQ99JT1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GatbQ99JT1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GatbQ99JT1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GatbQ99JT1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GatbQ99JT1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GatbQ99JT1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GatbQ99JT1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GatbQ99JT1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GatbQ99JT1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GatbQ99JT1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GatbQ99JT1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GatbQ99JT1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GatbQ99JT1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GatbQ99JT1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GatbQ99JT1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GatbQ99JT1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GatbQ99JT1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GatbQ99JT1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GatbQ99JT1 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GatbQ99JT1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GatbQ99JT1 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GatbQ99JT1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GatbQ99JT1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GatbQ99JT1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GatbQ99JT1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GatbQ99JT1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GatbQ99JT1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GatbQ99JT1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GatbQ99JT1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GatbQ99JT1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GatbQ99JT1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GatbQ99JT1 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GatbQ99JT1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GatbQ99JT1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GatbQ99JT1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GatbQ99JT1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GatbQ99JT1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GatbQ99JT1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GatbQ99JT1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GatbQ99JT1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GatbQ99JT1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GatbQ99JT1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GatbQ99JT1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GatbQ99JT1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GatbQ99JT1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GatbQ99JT1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GatbQ99JT1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GatbQ99JT1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GatbQ99JT1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GatbQ99JT1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GatbQ99JT1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GatbQ99JT1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GatbQ99JT1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GatbQ99JT1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GatbQ99JT1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GatbQ99JT1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GatbQ99JT1 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GatbQ99JT1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GatbQ99JT1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GatbQ99JT1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GatbQ99JT1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GatbQ99JT1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GatbQ99JT1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GatbQ99JT1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GatbQ99JT1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GatbQ99JT1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GatbQ99JT1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GatbQ99JT1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GatbQ99JT1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GatbQ99JT1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms