Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 AC022148.2-201ENST00000586176 560 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 ATXN3-201ENST00000340660 1205 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 METTL23-207ENST00000588783 1184 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms