Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Afg3l1Q920A7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Afg3l1Q920A7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Afg3l1Q920A7 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Afg3l1Q920A7 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Afg3l1Q920A7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Afg3l1Q920A7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Afg3l1Q920A7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Afg3l1Q920A7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Afg3l1Q920A7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Afg3l1Q920A7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Afg3l1Q920A7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Afg3l1Q920A7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Afg3l1Q920A7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Afg3l1Q920A7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Afg3l1Q920A7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Afg3l1Q920A7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Afg3l1Q920A7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Afg3l1Q920A7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Afg3l1Q920A7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Afg3l1Q920A7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Afg3l1Q920A7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Afg3l1Q920A7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Afg3l1Q920A7 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Afg3l1Q920A7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Afg3l1Q920A7 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Afg3l1Q920A7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Afg3l1Q920A7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Afg3l1Q920A7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Afg3l1Q920A7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Afg3l1Q920A7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Afg3l1Q920A7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Afg3l1Q920A7 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Afg3l1Q920A7 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Afg3l1Q920A7 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Afg3l1Q920A7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Afg3l1Q920A7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Afg3l1Q920A7 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Afg3l1Q920A7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Afg3l1Q920A7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Afg3l1Q920A7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Afg3l1Q920A7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Afg3l1Q920A7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Afg3l1Q920A7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Afg3l1Q920A7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Afg3l1Q920A7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Afg3l1Q920A7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Afg3l1Q920A7 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Afg3l1Q920A7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms