Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26540-201ENSMUST00000181858 1310 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ppargc1bQ8VHJ7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Ppargc1bQ8VHJ7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ppargc1bQ8VHJ7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ppargc1bQ8VHJ7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ppargc1bQ8VHJ7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ppargc1bQ8VHJ7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ppargc1bQ8VHJ7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ppargc1bQ8VHJ7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ppargc1bQ8VHJ7 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms