Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms