Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE20

9030612E09Rik, RIKEN cDNA 9030612E09, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9030612E09RikQ8CE20 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
9030612E09RikQ8CE20 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
9030612E09RikQ8CE20 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
9030612E09RikQ8CE20 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
9030612E09RikQ8CE20 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
9030612E09RikQ8CE20 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
9030612E09RikQ8CE20 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
9030612E09RikQ8CE20 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
9030612E09RikQ8CE20 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
9030612E09RikQ8CE20 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
9030612E09RikQ8CE20 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
9030612E09RikQ8CE20 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
9030612E09RikQ8CE20 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
9030612E09RikQ8CE20 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
9030612E09RikQ8CE20 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
9030612E09RikQ8CE20 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
9030612E09RikQ8CE20 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
9030612E09RikQ8CE20 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
9030612E09RikQ8CE20 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
9030612E09RikQ8CE20 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
9030612E09RikQ8CE20 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
9030612E09RikQ8CE20 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
9030612E09RikQ8CE20 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
9030612E09RikQ8CE20 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
9030612E09RikQ8CE20 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
9030612E09RikQ8CE20 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
9030612E09RikQ8CE20 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
9030612E09RikQ8CE20 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
9030612E09RikQ8CE20 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
9030612E09RikQ8CE20 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
9030612E09RikQ8CE20 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
9030612E09RikQ8CE20 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
9030612E09RikQ8CE20 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
9030612E09RikQ8CE20 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
9030612E09RikQ8CE20 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
9030612E09RikQ8CE20 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
9030612E09RikQ8CE20 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
9030612E09RikQ8CE20 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
9030612E09RikQ8CE20 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
9030612E09RikQ8CE20 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
9030612E09RikQ8CE20 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
9030612E09RikQ8CE20 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
9030612E09RikQ8CE20 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
9030612E09RikQ8CE20 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
9030612E09RikQ8CE20 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
9030612E09RikQ8CE20 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
9030612E09RikQ8CE20 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
9030612E09RikQ8CE20 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
9030612E09RikQ8CE20 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
9030612E09RikQ8CE20 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
9030612E09RikQ8CE20 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
9030612E09RikQ8CE20 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
9030612E09RikQ8CE20 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
9030612E09RikQ8CE20 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
9030612E09RikQ8CE20 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
9030612E09RikQ8CE20 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
9030612E09RikQ8CE20 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
9030612E09RikQ8CE20 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
9030612E09RikQ8CE20 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
9030612E09RikQ8CE20 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
9030612E09RikQ8CE20 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
9030612E09RikQ8CE20 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
9030612E09RikQ8CE20 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
9030612E09RikQ8CE20 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
9030612E09RikQ8CE20 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
9030612E09RikQ8CE20 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
9030612E09RikQ8CE20 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
9030612E09RikQ8CE20 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
9030612E09RikQ8CE20 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
9030612E09RikQ8CE20 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
9030612E09RikQ8CE20 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
9030612E09RikQ8CE20 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
9030612E09RikQ8CE20 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
9030612E09RikQ8CE20 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
9030612E09RikQ8CE20 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
9030612E09RikQ8CE20 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
9030612E09RikQ8CE20 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
9030612E09RikQ8CE20 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
9030612E09RikQ8CE20 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
9030612E09RikQ8CE20 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
9030612E09RikQ8CE20 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
9030612E09RikQ8CE20 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
9030612E09RikQ8CE20 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
9030612E09RikQ8CE20 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
9030612E09RikQ8CE20 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
9030612E09RikQ8CE20 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
9030612E09RikQ8CE20 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
9030612E09RikQ8CE20 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
9030612E09RikQ8CE20 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
9030612E09RikQ8CE20 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
9030612E09RikQ8CE20 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
9030612E09RikQ8CE20 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
9030612E09RikQ8CE20 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
9030612E09RikQ8CE20 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
9030612E09RikQ8CE20 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
9030612E09RikQ8CE20 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
9030612E09RikQ8CE20 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
9030612E09RikQ8CE20 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
9030612E09RikQ8CE20 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
9030612E09RikQ8CE20 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms