Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYI9

Tnr, Tenascin-R, mousemouse

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnrQ8BYI9 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TnrQ8BYI9 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TnrQ8BYI9 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TnrQ8BYI9 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TnrQ8BYI9 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TnrQ8BYI9 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TnrQ8BYI9 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TnrQ8BYI9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TnrQ8BYI9 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TnrQ8BYI9 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TnrQ8BYI9 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TnrQ8BYI9 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TnrQ8BYI9 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TnrQ8BYI9 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TnrQ8BYI9 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TnrQ8BYI9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TnrQ8BYI9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TnrQ8BYI9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TnrQ8BYI9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TnrQ8BYI9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TnrQ8BYI9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TnrQ8BYI9 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TnrQ8BYI9 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TnrQ8BYI9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TnrQ8BYI9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TnrQ8BYI9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TnrQ8BYI9 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TnrQ8BYI9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TnrQ8BYI9 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TnrQ8BYI9 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TnrQ8BYI9 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TnrQ8BYI9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TnrQ8BYI9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TnrQ8BYI9 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TnrQ8BYI9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TnrQ8BYI9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TnrQ8BYI9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TnrQ8BYI9 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TnrQ8BYI9 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TnrQ8BYI9 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TnrQ8BYI9 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TnrQ8BYI9 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TnrQ8BYI9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TnrQ8BYI9 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TnrQ8BYI9 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TnrQ8BYI9 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TnrQ8BYI9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TnrQ8BYI9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TnrQ8BYI9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TnrQ8BYI9 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TnrQ8BYI9 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TnrQ8BYI9 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TnrQ8BYI9 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TnrQ8BYI9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TnrQ8BYI9 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TnrQ8BYI9 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TnrQ8BYI9 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TnrQ8BYI9 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TnrQ8BYI9 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TnrQ8BYI9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TnrQ8BYI9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TnrQ8BYI9 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TnrQ8BYI9 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TnrQ8BYI9 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TnrQ8BYI9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TnrQ8BYI9 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TnrQ8BYI9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TnrQ8BYI9 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
TnrQ8BYI9 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
TnrQ8BYI9 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TnrQ8BYI9 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
TnrQ8BYI9 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TnrQ8BYI9 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TnrQ8BYI9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
TnrQ8BYI9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TnrQ8BYI9 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TnrQ8BYI9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TnrQ8BYI9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TnrQ8BYI9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TnrQ8BYI9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TnrQ8BYI9 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TnrQ8BYI9 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TnrQ8BYI9 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TnrQ8BYI9 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TnrQ8BYI9 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TnrQ8BYI9 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TnrQ8BYI9 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TnrQ8BYI9 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TnrQ8BYI9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TnrQ8BYI9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TnrQ8BYI9 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TnrQ8BYI9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TnrQ8BYI9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TnrQ8BYI9 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TnrQ8BYI9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TnrQ8BYI9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TnrQ8BYI9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TnrQ8BYI9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TnrQ8BYI9 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TnrQ8BYI9 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms