Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTQ0

PcgF3, Polycomb group RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcgF3Q8BTQ0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PcgF3Q8BTQ0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms