Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Prrc2bQ7TPM1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prrc2bQ7TPM1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prrc2bQ7TPM1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prrc2bQ7TPM1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prrc2bQ7TPM1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prrc2bQ7TPM1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prrc2bQ7TPM1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prrc2bQ7TPM1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prrc2bQ7TPM1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prrc2bQ7TPM1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prrc2bQ7TPM1 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prrc2bQ7TPM1 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Prrc2bQ7TPM1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prrc2bQ7TPM1 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prrc2bQ7TPM1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prrc2bQ7TPM1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prrc2bQ7TPM1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prrc2bQ7TPM1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prrc2bQ7TPM1 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prrc2bQ7TPM1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prrc2bQ7TPM1 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Prrc2bQ7TPM1 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prrc2bQ7TPM1 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prrc2bQ7TPM1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prrc2bQ7TPM1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prrc2bQ7TPM1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prrc2bQ7TPM1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prrc2bQ7TPM1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prrc2bQ7TPM1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prrc2bQ7TPM1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prrc2bQ7TPM1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prrc2bQ7TPM1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prrc2bQ7TPM1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prrc2bQ7TPM1 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prrc2bQ7TPM1 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prrc2bQ7TPM1 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prrc2bQ7TPM1 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Prrc2bQ7TPM1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prrc2bQ7TPM1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prrc2bQ7TPM1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prrc2bQ7TPM1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prrc2bQ7TPM1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prrc2bQ7TPM1 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prrc2bQ7TPM1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prrc2bQ7TPM1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prrc2bQ7TPM1 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Prrc2bQ7TPM1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prrc2bQ7TPM1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prrc2bQ7TPM1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prrc2bQ7TPM1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prrc2bQ7TPM1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prrc2bQ7TPM1 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prrc2bQ7TPM1 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prrc2bQ7TPM1 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Prrc2bQ7TPM1 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prrc2bQ7TPM1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prrc2bQ7TPM1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prrc2bQ7TPM1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prrc2bQ7TPM1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prrc2bQ7TPM1 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prrc2bQ7TPM1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prrc2bQ7TPM1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prrc2bQ7TPM1 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Prrc2bQ7TPM1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prrc2bQ7TPM1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prrc2bQ7TPM1 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prrc2bQ7TPM1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prrc2bQ7TPM1 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prrc2bQ7TPM1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prrc2bQ7TPM1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prrc2bQ7TPM1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prrc2bQ7TPM1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prrc2bQ7TPM1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prrc2bQ7TPM1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prrc2bQ7TPM1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prrc2bQ7TPM1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prrc2bQ7TPM1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prrc2bQ7TPM1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prrc2bQ7TPM1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prrc2bQ7TPM1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prrc2bQ7TPM1 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prrc2bQ7TPM1 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prrc2bQ7TPM1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Prrc2bQ7TPM1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prrc2bQ7TPM1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prrc2bQ7TPM1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prrc2bQ7TPM1 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prrc2bQ7TPM1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Prrc2bQ7TPM1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Prrc2bQ7TPM1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Prrc2bQ7TPM1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Prrc2bQ7TPM1 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Prrc2bQ7TPM1 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Prrc2bQ7TPM1 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Prrc2bQ7TPM1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prrc2bQ7TPM1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prrc2bQ7TPM1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prrc2bQ7TPM1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prrc2bQ7TPM1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms