Protein–RNA interactions for Protein: Q62189

Snrpa, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpaQ62189 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SnrpaQ62189 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SnrpaQ62189 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SnrpaQ62189 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SnrpaQ62189 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SnrpaQ62189 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SnrpaQ62189 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SnrpaQ62189 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SnrpaQ62189 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SnrpaQ62189 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SnrpaQ62189 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SnrpaQ62189 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SnrpaQ62189 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SnrpaQ62189 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SnrpaQ62189 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SnrpaQ62189 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SnrpaQ62189 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SnrpaQ62189 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SnrpaQ62189 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SnrpaQ62189 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SnrpaQ62189 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SnrpaQ62189 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SnrpaQ62189 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SnrpaQ62189 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SnrpaQ62189 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SnrpaQ62189 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SnrpaQ62189 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SnrpaQ62189 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SnrpaQ62189 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SnrpaQ62189 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SnrpaQ62189 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SnrpaQ62189 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SnrpaQ62189 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SnrpaQ62189 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SnrpaQ62189 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SnrpaQ62189 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SnrpaQ62189 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SnrpaQ62189 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SnrpaQ62189 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SnrpaQ62189 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SnrpaQ62189 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SnrpaQ62189 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SnrpaQ62189 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SnrpaQ62189 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SnrpaQ62189 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SnrpaQ62189 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SnrpaQ62189 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SnrpaQ62189 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SnrpaQ62189 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SnrpaQ62189 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SnrpaQ62189 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SnrpaQ62189 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SnrpaQ62189 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SnrpaQ62189 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SnrpaQ62189 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SnrpaQ62189 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SnrpaQ62189 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SnrpaQ62189 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SnrpaQ62189 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SnrpaQ62189 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SnrpaQ62189 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SnrpaQ62189 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SnrpaQ62189 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SnrpaQ62189 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SnrpaQ62189 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SnrpaQ62189 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SnrpaQ62189 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SnrpaQ62189 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SnrpaQ62189 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SnrpaQ62189 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SnrpaQ62189 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SnrpaQ62189 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SnrpaQ62189 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SnrpaQ62189 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SnrpaQ62189 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SnrpaQ62189 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SnrpaQ62189 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SnrpaQ62189 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SnrpaQ62189 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SnrpaQ62189 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SnrpaQ62189 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SnrpaQ62189 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SnrpaQ62189 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SnrpaQ62189 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SnrpaQ62189 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SnrpaQ62189 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SnrpaQ62189 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SnrpaQ62189 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SnrpaQ62189 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SnrpaQ62189 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SnrpaQ62189 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SnrpaQ62189 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SnrpaQ62189 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SnrpaQ62189 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SnrpaQ62189 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SnrpaQ62189 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SnrpaQ62189 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SnrpaQ62189 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SnrpaQ62189 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SnrpaQ62189 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms