Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms