Protein–RNA interactions for Protein: Q5U458

Dnajc11, DnaJ homolog subfamily C member 11, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc11Q5U458 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnajc11Q5U458 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms