Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ81

Cnep1r1, Nuclear envelope phosphatase-regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnep1r1Q3UJ81 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cnep1r1Q3UJ81 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms