Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc34Q3UI66 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc34Q3UI66 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms