Protein–RNA interactions for Protein: Q3T9V6

Gm21370, Predicted gene, 21188, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21370Q3T9V6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21370Q3T9V6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21370Q3T9V6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21370Q3T9V6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21370Q3T9V6 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21370Q3T9V6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21370Q3T9V6 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21370Q3T9V6 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21370Q3T9V6 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21370Q3T9V6 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21370Q3T9V6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21370Q3T9V6 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21370Q3T9V6 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21370Q3T9V6 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21370Q3T9V6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21370Q3T9V6 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21370Q3T9V6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21370Q3T9V6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21370Q3T9V6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21370Q3T9V6 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21370Q3T9V6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21370Q3T9V6 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21370Q3T9V6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21370Q3T9V6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21370Q3T9V6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21370Q3T9V6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21370Q3T9V6 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21370Q3T9V6 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21370Q3T9V6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21370Q3T9V6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21370Q3T9V6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21370Q3T9V6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21370Q3T9V6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21370Q3T9V6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21370Q3T9V6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21370Q3T9V6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21370Q3T9V6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21370Q3T9V6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21370Q3T9V6 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21370Q3T9V6 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21370Q3T9V6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21370Q3T9V6 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21370Q3T9V6 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21370Q3T9V6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21370Q3T9V6 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21370Q3T9V6 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21370Q3T9V6 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21370Q3T9V6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21370Q3T9V6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm21370Q3T9V6 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm21370Q3T9V6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm21370Q3T9V6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm21370Q3T9V6 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm21370Q3T9V6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm21370Q3T9V6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm21370Q3T9V6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm21370Q3T9V6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm21370Q3T9V6 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm21370Q3T9V6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm21370Q3T9V6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm21370Q3T9V6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm21370Q3T9V6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm21370Q3T9V6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm21370Q3T9V6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm21370Q3T9V6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm21370Q3T9V6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm21370Q3T9V6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm21370Q3T9V6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm21370Q3T9V6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm21370Q3T9V6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm21370Q3T9V6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm21370Q3T9V6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm21370Q3T9V6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm21370Q3T9V6 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm21370Q3T9V6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm21370Q3T9V6 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm21370Q3T9V6 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm21370Q3T9V6 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm21370Q3T9V6 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm21370Q3T9V6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21370Q3T9V6 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21370Q3T9V6 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21370Q3T9V6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21370Q3T9V6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21370Q3T9V6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21370Q3T9V6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21370Q3T9V6 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21370Q3T9V6 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21370Q3T9V6 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21370Q3T9V6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21370Q3T9V6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21370Q3T9V6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21370Q3T9V6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21370Q3T9V6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21370Q3T9V6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21370Q3T9V6 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21370Q3T9V6 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21370Q3T9V6 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21370Q3T9V6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21370Q3T9V6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms