Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
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