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Protein–RNA interactions for Protein: Q12090
REX3, RNA exonuclease 3, yeast
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404 aa
.
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
REX3
Q12090
YPL068C
YPL068C
882 nt
0.42
□□□□□ -2.34
REX3
Q12090
THO2
YNL139C
4794 nt
0.42
□□□□□ -2.34
REX3
Q12090
VPS20
YMR077C
666 nt
0.41
□□□□□ -2.34
REX3
Q12090
YMR321C
YMR321C
318 nt
0.41
□□□□□ -2.34
REX3
Q12090
YPR160W-A
YPR160W-A
81 nt
0.41
□□□□□ -2.34
REX3
Q12090
YHL046W-A
YHL046W-A
327 nt
0.4
□□□□□ -2.35
REX3
Q12090
YLR434C
YLR434C
384 nt
0.4
□□□□□ -2.35
REX3
Q12090
VIK1
YPL253C
1944 nt
0.4
□□□□□ -2.35
REX3
Q12090
HAL9
YOL089C
3093 nt
0.39
□□□□□ -2.35
REX3
Q12090
ASE1
YOR058C
2658 nt
0.39
□□□□□ -2.35
REX3
Q12090
COX5B
YIL111W
456 nt
0.39
□□□□□ -2.35
REX3
Q12090
YNL211C
YNL211C
261 nt
0.39
□□□□□ -2.35
REX3
Q12090
SBH1
YER087C-B
249 nt
0.38
□□□□□ -2.35
REX3
Q12090
YLR202C
YLR202C
327 nt
0.38
□□□□□ -2.35
REX3
Q12090
YAL067W-A
YAL067W-A
228 nt
0.37
□□□□□ -2.35
REX3
Q12090
YLR334C
YLR334C
381 nt
0.37
□□□□□ -2.35
REX3
Q12090
YPL205C
YPL205C
345 nt
0.37
□□□□□ -2.35
REX3
Q12090
YFR012W-A
YFR012W-A
87 nt
0.35
□□□□□ -2.35
REX3
Q12090
RPS25B
YLR333C
327 nt
0.35
□□□□□ -2.35
REX3
Q12090
ABF2
YMR072W
552 nt
0.34
□□□□□ -2.36
REX3
Q12090
YPL225W
YPL225W
441 nt
0.34
□□□□□ -2.36
REX3
Q12090
PRP5
YBR237W
2550 nt
0.34
□□□□□ -2.36
REX3
Q12090
OST4
YDL232W
111 nt
0.33
□□□□□ -2.36
REX3
Q12090
PRP42
YDR235W
1635 nt
0.32
□□□□□ -2.36
REX3
Q12090
YJL120W
YJL120W
324 nt
0.31
□□□□□ -2.36
REX3
Q12090
YHR007C-A
YHR007C-A
216 nt
0.3
□□□□□ -2.36
REX3
Q12090
TAR1
YLR154W-C
375 nt
0.3
□□□□□ -2.36
REX3
Q12090
YNL324W
YNL324W
396 nt
0.3
□□□□□ -2.36
REX3
Q12090
SGF11
YPL047W
300 nt
0.29
□□□□□ -2.36
REX3
Q12090
YMR307C-A
YMR307C-A
195 nt
0.28
□□□□□ -2.36
REX3
Q12090
Q0017
Q0017
162 nt
0.28
□□□□□ -2.36
REX3
Q12090
YAR029W
YAR029W
225 nt
0.27
□□□□□ -2.37
REX3
Q12090
snR190
snR190
190 nt
0.27
□□□□□ -2.37
REX3
Q12090
YHR138C
YHR138C
345 nt
0.26
□□□□□ -2.37
REX3
Q12090
YCR018C-A
YCR018C-A
255 nt
0.25
□□□□□ -2.37
REX3
Q12090
YER078W-A
YER078W-A
165 nt
0.25
□□□□□ -2.37
REX3
Q12090
CSN9
YDR179C
489 nt
0.24
□□□□□ -2.37
REX3
Q12090
YBR285W
YBR285W
435 nt
0.24
□□□□□ -2.37
REX3
Q12090
YOL013W-A
YOL013W-A
192 nt
0.23
□□□□□ -2.37
REX3
Q12090
YOR121C
YOR121C
306 nt
0.23
□□□□□ -2.37
REX3
Q12090
BUL2
YML111W
2763 nt
0.23
□□□□□ -2.37
REX3
Q12090
MYO1
YHR023W
5787 nt
0.22
□□□□□ -2.37
REX3
Q12090
AGA2
YGL032C
264 nt
0.22
□□□□□ -2.37
REX3
Q12090
LEE1
YPL054W
906 nt
0.22
□□□□□ -2.37
REX3
Q12090
PRM3
YPL192C
402 nt
0.22
□□□□□ -2.37
REX3
Q12090
HTB2
YBL002W
396 nt
0.21
□□□□□ -2.38
REX3
Q12090
YNL054W-B
YNL054W-B
5250 nt
0.2
□□□□□ -2.38
REX3
Q12090
YDL185C-A
YDL185C-A
228 nt
0.2
□□□□□ -2.38
REX3
Q12090
YER079W
YER079W
633 nt
0.19
□□□□□ -2.38
REX3
Q12090
YOR192C-B
YOR192C-B
5313 nt
0.19
□□□□□ -2.38
REX3
Q12090
NNF2
YGR089W
2811 nt
0.18
□□□□□ -2.38
REX3
Q12090
YER137W-A
YER137W-A
306 nt
0.17
□□□□□ -2.38
REX3
Q12090
YAR053W
YAR053W
297 nt
0.17
□□□□□ -2.38
REX3
Q12090
YMR001C-A
YMR001C-A
231 nt
0.17
□□□□□ -2.38
REX3
Q12090
YBL100W-B
YBL100W-B
5313 nt
0.16
□□□□□ -2.38
REX3
Q12090
UTP8
YGR128C
2142 nt
0.16
□□□□□ -2.38
REX3
Q12090
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YLR264C-A
117 nt
0.16
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REX3
Q12090
YOR345C
YOR345C
351 nt
0.16
□□□□□ -2.38
REX3
Q12090
YDR371C-A
YDR371C-A
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0.14
□□□□□ -2.39
REX3
Q12090
RPL35A
YDL191W
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0.13
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REX3
Q12090
YKL136W
YKL136W
399 nt
0.13
□□□□□ -2.39
REX3
Q12090
YOR186C-A
YOR186C-A
210 nt
0.13
□□□□□ -2.39
REX3
Q12090
RPS26A
YGL189C
360 nt
0.12
□□□□□ -2.39
REX3
Q12090
tN(GUU)Q
tN(GUU)Q
71 nt
0.12
□□□□□ -2.39
REX3
Q12090
BIL1
YOR304C-A
231 nt
0.11
□□□□□ -2.39
REX3
Q12090
YCR022C
YCR022C
345 nt
0.1
□□□□□ -2.39
REX3
Q12090
YAL063C-A
YAL063C-A
291 nt
0.1
□□□□□ -2.39
REX3
Q12090
YLR282C
YLR282C
342 nt
0.1
□□□□□ -2.39
REX3
Q12090
CSE2
YNR010W
450 nt
0.1
□□□□□ -2.39
REX3
Q12090
ESP1
YGR098C
4893 nt
0.1
□□□□□ -2.39
REX3
Q12090
RPS27B
YHR021C
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REX3
Q12090
COX12
YLR038C
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0.09
□□□□□ -2.4
REX3
Q12090
YNL146W
YNL146W
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0.09
□□□□□ -2.4
REX3
Q12090
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YLL004W
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0.09
□□□□□ -2.4
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Q12090
PRP39
YML046W
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□□□□□ -2.4
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Q12090
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YDR086C
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□□□□□ -2.4
REX3
Q12090
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YDR354C-A
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□□□□□ -2.4
REX3
Q12090
RCO1
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□□□□□ -2.4
REX3
Q12090
NIP1
YMR309C
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□□□□□ -2.4
REX3
Q12090
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YJL026C-A
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□□□□□ -2.4
REX3
Q12090
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YAL068W-A
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0.07
□□□□□ -2.4
REX3
Q12090
COG8
YML071C
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0.07
□□□□□ -2.4
REX3
Q12090
ULI1
YFR026C
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□□□□□ -2.4
REX3
Q12090
YJR157W
YJR157W
363 nt
0.05
□□□□□ -2.4
REX3
Q12090
YKL100W-A
YKL100W-A
90 nt
0.05
□□□□□ -2.4
REX3
Q12090
YEL020C-B
YEL020C-B
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0.04
□□□□□ -2.4
REX3
Q12090
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YHR131W-A
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0.03
□□□□□ -2.4
REX3
Q12090
tW(UCA)Q
tW(UCA)Q
74 nt
0.03
□□□□□ -2.4
REX3
Q12090
snR45
snR45
172 nt
0.03
□□□□□ -2.4
REX3
Q12090
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YDR048C
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□□□□□ -2.41
REX3
Q12090
YPR092W
YPR092W
306 nt
0.02
□□□□□ -2.41
REX3
Q12090
COY1
YKL179C
2040 nt
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□□□□□ -2.41
REX3
Q12090
YGR035C
YGR035C
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0.01
□□□□□ -2.41
REX3
Q12090
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YIL115W-A
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0.01
□□□□□ -2.41
REX3
Q12090
BLI1
YKL061W
342 nt
0.01
□□□□□ -2.41
REX3
Q12090
YLL006W-A
YLL006W-A
177 nt
0.01
□□□□□ -2.41
REX3
Q12090
YKU70
YMR284W
1809 nt
-0.03
□□□□□ -2.41
REX3
Q12090
YGL123C-A
YGL123C-A
231 nt
-0.03
□□□□□ -2.41
REX3
Q12090
YLR154W-F
YLR154W-F
141 nt
-0.04
□□□□□ -2.42
REX3
Q12090
YLR041W
YLR041W
321 nt
-0.05
□□□□□ -2.42
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