Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms