Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms