Protein–RNA interactions for Protein: Q04461

YMR111C, Uncharacterized protein YMR111C, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR111CQ04461 CHS6YJL099W 2241 nt0.55□□□□□ -2.32
YMR111CQ04461 YHR138CYHR138C 345 nt0.54□□□□□ -2.32
YMR111CQ04461 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt0.54□□□□□ -2.32
YMR111CQ04461 MCM10YIL150C 1716 nt0.53□□□□□ -2.32
YMR111CQ04461 YLR334CYLR334C 381 nt0.53□□□□□ -2.32
YMR111CQ04461 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.53□□□□□ -2.32
YMR111CQ04461 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt0.52□□□□□ -2.33
YMR111CQ04461 RPS25BYLR333C 327 nt0.52□□□□□ -2.33
YMR111CQ04461 LEE1YPL054W 906 nt0.52□□□□□ -2.33
YMR111CQ04461 YER137W-AYER137W-A 306 nt0.51□□□□□ -2.33
YMR111CQ04461 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt0.51□□□□□ -2.33
YMR111CQ04461 YJR157WYJR157W 363 nt0.51□□□□□ -2.33
YMR111CQ04461 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.51□□□□□ -2.33
YMR111CQ04461 YAR053WYAR053W 297 nt0.51□□□□□ -2.33
YMR111CQ04461 YMR321CYMR321C 318 nt0.51□□□□□ -2.33
YMR111CQ04461 HAL9YOL089C 3093 nt0.5□□□□□ -2.33
YMR111CQ04461 HTB2YBL002W 396 nt0.5□□□□□ -2.33
YMR111CQ04461 BIL1YOR304C-A 231 nt0.5□□□□□ -2.33
YMR111CQ04461 ESP1YGR098C 4893 nt0.5□□□□□ -2.33
YMR111CQ04461 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt0.49□□□□□ -2.33
YMR111CQ04461 YJL120WYJL120W 324 nt0.49□□□□□ -2.33
YMR111CQ04461 YAR029WYAR029W 225 nt0.49□□□□□ -2.33
YMR111CQ04461 YLR154W-FYLR154W-F 141 nt0.49□□□□□ -2.33
YMR111CQ04461 YOL014WYOL014W 375 nt0.49□□□□□ -2.33
YMR111CQ04461 YPL225WYPL225W 441 nt0.49□□□□□ -2.33
YMR111CQ04461 ULP2YIL031W 3105 nt0.49□□□□□ -2.33
YMR111CQ04461 ABF2YMR072W 552 nt0.48□□□□□ -2.33
YMR111CQ04461 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.48□□□□□ -2.33
YMR111CQ04461 FYV10YIL097W 1551 nt0.48□□□□□ -2.33
YMR111CQ04461 CSN9YDR179C 489 nt0.47□□□□□ -2.33
YMR111CQ04461 Q0144Q0144 330 nt0.47□□□□□ -2.33
YMR111CQ04461 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt0.47□□□□□ -2.33
YMR111CQ04461 YLR222C-AYLR222C-A 231 nt0.47□□□□□ -2.33
YMR111CQ04461 YNL211CYNL211C 261 nt0.47□□□□□ -2.33
YMR111CQ04461 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.46□□□□□ -2.34
YMR111CQ04461 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.46□□□□□ -2.34
YMR111CQ04461 FMP27YLR454W 7887 nt0.45□□□□□ -2.34
YMR111CQ04461 YGR035CYGR035C 351 nt0.45□□□□□ -2.34
YMR111CQ04461 COX5BYIL111W 456 nt0.45□□□□□ -2.34
YMR111CQ04461 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt0.44□□□□□ -2.34
YMR111CQ04461 PET111YMR257C 2403 nt0.44□□□□□ -2.34
YMR111CQ04461 ASE1YOR058C 2658 nt0.43□□□□□ -2.34
YMR111CQ04461 TAR1YLR154W-C 375 nt0.43□□□□□ -2.34
YMR111CQ04461 VIK1YPL253C 1944 nt0.42□□□□□ -2.34
YMR111CQ04461 AI1Q0050 2505 nt0.41□□□□□ -2.34
YMR111CQ04461 RPL35AYDL191W 363 nt0.41□□□□□ -2.34
YMR111CQ04461 TRS65YGR166W 1683 nt0.4□□□□□ -2.34
YMR111CQ04461 SGF11YPL047W 300 nt0.4□□□□□ -2.35
YMR111CQ04461 PRP42YDR235W 1635 nt0.39□□□□□ -2.35
YMR111CQ04461 PRP5YBR237W 2550 nt0.39□□□□□ -2.35
YMR111CQ04461 OST4YDL232W 111 nt0.39□□□□□ -2.35
YMR111CQ04461 YDR157WYDR157W 402 nt0.39□□□□□ -2.35
YMR111CQ04461 CSE2YNR010W 450 nt0.39□□□□□ -2.35
YMR111CQ04461 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt0.38□□□□□ -2.35
YMR111CQ04461 snR190snR190 190 nt0.38□□□□□ -2.35
YMR111CQ04461 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.37□□□□□ -2.35
YMR111CQ04461 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.37□□□□□ -2.35
YMR111CQ04461 SSS1YDR086C 243 nt0.36□□□□□ -2.35
YMR111CQ04461 SBH1YER087C-B 249 nt0.35□□□□□ -2.35
YMR111CQ04461 RPS27BYHR021C 249 nt0.35□□□□□ -2.35
YMR111CQ04461 YOR293C-AYOR293C-A 150 nt0.35□□□□□ -2.35
YMR111CQ04461 BIR1YJR089W 2865 nt0.35□□□□□ -2.35
YMR111CQ04461 VAR1Q0140 1197 nt0.33□□□□□ -2.36
YMR111CQ04461 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt0.33□□□□□ -2.36
YMR111CQ04461 YDR048CYDR048C 315 nt0.32□□□□□ -2.36
YMR111CQ04461 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt0.32□□□□□ -2.36
YMR111CQ04461 COG8YML071C 1824 nt0.31□□□□□ -2.36
YMR111CQ04461 YKL136WYKL136W 399 nt0.3□□□□□ -2.36
YMR111CQ04461 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.29□□□□□ -2.36
YMR111CQ04461 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt0.28□□□□□ -2.36
YMR111CQ04461 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt0.28□□□□□ -2.36
YMR111CQ04461 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.27□□□□□ -2.37
YMR111CQ04461 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt0.27□□□□□ -2.37
YMR111CQ04461 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt0.27□□□□□ -2.37
YMR111CQ04461 STE5YDR103W 2754 nt0.26□□□□□ -2.37
YMR111CQ04461 HTL1YCR020W-B 237 nt0.26□□□□□ -2.37
YMR111CQ04461 YLR282CYLR282C 342 nt0.26□□□□□ -2.37
YMR111CQ04461 NNF2YGR089W 2811 nt0.26□□□□□ -2.37
YMR111CQ04461 YCR022CYCR022C 345 nt0.25□□□□□ -2.37
YMR111CQ04461 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt0.25□□□□□ -2.37
YMR111CQ04461 THO2YNL139C 4794 nt0.23□□□□□ -2.37
YMR111CQ04461 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.23□□□□□ -2.37
YMR111CQ04461 YOR345CYOR345C 351 nt0.23□□□□□ -2.37
YMR111CQ04461 BLI1YKL061W 342 nt0.22□□□□□ -2.37
YMR111CQ04461 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt0.22□□□□□ -2.37
YMR111CQ04461 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt0.22□□□□□ -2.37
YMR111CQ04461 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt0.22□□□□□ -2.37
YMR111CQ04461 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt0.21□□□□□ -2.38
YMR111CQ04461 YER078W-AYER078W-A 165 nt0.2□□□□□ -2.38
YMR111CQ04461 YFL019CYFL019C 354 nt0.2□□□□□ -2.38
YMR111CQ04461 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt0.2□□□□□ -2.38
YMR111CQ04461 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt0.2□□□□□ -2.38
YMR111CQ04461 RPS26AYGL189C 360 nt0.19□□□□□ -2.38
YMR111CQ04461 YPR012WYPR012W 255 nt0.19□□□□□ -2.38
YMR111CQ04461 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt0.18□□□□□ -2.38
YMR111CQ04461 ULI1YFR026C 510 nt0.18□□□□□ -2.38
YMR111CQ04461 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt0.18□□□□□ -2.38
YMR111CQ04461 NIP1YMR309C 2439 nt0.18□□□□□ -2.38
YMR111CQ04461 COY1YKL179C 2040 nt0.18□□□□□ -2.38
YMR111CQ04461 snR60snR60 104 nt0.17□□□□□ -2.38
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17.5 ms