Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pax5Q02650 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms