Protein–RNA interactions for Protein: P70459

Erf, ETS domain-containing transcription factor ERF, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ErfP70459 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ErfP70459 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ErfP70459 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ErfP70459 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ErfP70459 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ErfP70459 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ErfP70459 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ErfP70459 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ErfP70459 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ErfP70459 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ErfP70459 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ErfP70459 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ErfP70459 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ErfP70459 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ErfP70459 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ErfP70459 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ErfP70459 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ErfP70459 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ErfP70459 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ErfP70459 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ErfP70459 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ErfP70459 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ErfP70459 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ErfP70459 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ErfP70459 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ErfP70459 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ErfP70459 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ErfP70459 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ErfP70459 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ErfP70459 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ErfP70459 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ErfP70459 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ErfP70459 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ErfP70459 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ErfP70459 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ErfP70459 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ErfP70459 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ErfP70459 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ErfP70459 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ErfP70459 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ErfP70459 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ErfP70459 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ErfP70459 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ErfP70459 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ErfP70459 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ErfP70459 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ErfP70459 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ErfP70459 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ErfP70459 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ErfP70459 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ErfP70459 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ErfP70459 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ErfP70459 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ErfP70459 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ErfP70459 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ErfP70459 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ErfP70459 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ErfP70459 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ErfP70459 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ErfP70459 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ErfP70459 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ErfP70459 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ErfP70459 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ErfP70459 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ErfP70459 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ErfP70459 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ErfP70459 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ErfP70459 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ErfP70459 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ErfP70459 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ErfP70459 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ErfP70459 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ErfP70459 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ErfP70459 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ErfP70459 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ErfP70459 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ErfP70459 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ErfP70459 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ErfP70459 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ErfP70459 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ErfP70459 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ErfP70459 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ErfP70459 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ErfP70459 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ErfP70459 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ErfP70459 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ErfP70459 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ErfP70459 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ErfP70459 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ErfP70459 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ErfP70459 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ErfP70459 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ErfP70459 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ErfP70459 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ErfP70459 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ErfP70459 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ErfP70459 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ErfP70459 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ErfP70459 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ErfP70459 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms