Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ctdsp1P58466 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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