Protein–RNA interactions for Protein: P51670

Ccl9, C-C motif chemokine 9, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl9P51670 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl9P51670 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms