Protein–RNA interactions for Protein: P50752

Tnnt2, Troponin T, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt2P50752 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnnt2P50752 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnnt2P50752 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnnt2P50752 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnnt2P50752 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnnt2P50752 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnnt2P50752 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnnt2P50752 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnnt2P50752 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnnt2P50752 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnnt2P50752 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnnt2P50752 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnnt2P50752 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnnt2P50752 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnnt2P50752 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnnt2P50752 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnnt2P50752 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnnt2P50752 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnnt2P50752 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnnt2P50752 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnnt2P50752 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnnt2P50752 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnnt2P50752 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnnt2P50752 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnnt2P50752 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnnt2P50752 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnnt2P50752 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnnt2P50752 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnnt2P50752 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnnt2P50752 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnnt2P50752 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnnt2P50752 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnnt2P50752 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnnt2P50752 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnnt2P50752 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnnt2P50752 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnnt2P50752 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnnt2P50752 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnnt2P50752 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnnt2P50752 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnnt2P50752 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnnt2P50752 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnnt2P50752 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnnt2P50752 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnnt2P50752 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnnt2P50752 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnnt2P50752 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnnt2P50752 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnnt2P50752 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnnt2P50752 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnnt2P50752 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnnt2P50752 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnnt2P50752 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnnt2P50752 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnnt2P50752 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnnt2P50752 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnnt2P50752 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnnt2P50752 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnnt2P50752 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnnt2P50752 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnnt2P50752 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tnnt2P50752 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tnnt2P50752 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tnnt2P50752 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tnnt2P50752 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tnnt2P50752 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Tnnt2P50752 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tnnt2P50752 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tnnt2P50752 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tnnt2P50752 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tnnt2P50752 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tnnt2P50752 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Tnnt2P50752 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tnnt2P50752 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tnnt2P50752 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tnnt2P50752 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tnnt2P50752 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tnnt2P50752 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tnnt2P50752 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tnnt2P50752 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tnnt2P50752 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tnnt2P50752 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tnnt2P50752 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tnnt2P50752 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tnnt2P50752 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Tnnt2P50752 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tnnt2P50752 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tnnt2P50752 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tnnt2P50752 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tnnt2P50752 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tnnt2P50752 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tnnt2P50752 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tnnt2P50752 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tnnt2P50752 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tnnt2P50752 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tnnt2P50752 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tnnt2P50752 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tnnt2P50752 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tnnt2P50752 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Tnnt2P50752 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms