Protein–RNA interactions for Protein: P49817

Cav1, Caveolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cav1P49817 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cav1P49817 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cav1P49817 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Cav1P49817 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cav1P49817 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cav1P49817 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cav1P49817 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cav1P49817 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cav1P49817 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cav1P49817 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cav1P49817 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cav1P49817 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cav1P49817 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cav1P49817 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cav1P49817 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cav1P49817 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cav1P49817 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cav1P49817 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cav1P49817 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cav1P49817 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cav1P49817 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cav1P49817 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cav1P49817 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cav1P49817 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cav1P49817 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cav1P49817 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Cav1P49817 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cav1P49817 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cav1P49817 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cav1P49817 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cav1P49817 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cav1P49817 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cav1P49817 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cav1P49817 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cav1P49817 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cav1P49817 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cav1P49817 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cav1P49817 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cav1P49817 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cav1P49817 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cav1P49817 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cav1P49817 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cav1P49817 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cav1P49817 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cav1P49817 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cav1P49817 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cav1P49817 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cav1P49817 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cav1P49817 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cav1P49817 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cav1P49817 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cav1P49817 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cav1P49817 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cav1P49817 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cav1P49817 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cav1P49817 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cav1P49817 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cav1P49817 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cav1P49817 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cav1P49817 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cav1P49817 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cav1P49817 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cav1P49817 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cav1P49817 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cav1P49817 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cav1P49817 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cav1P49817 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cav1P49817 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cav1P49817 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cav1P49817 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cav1P49817 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cav1P49817 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cav1P49817 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cav1P49817 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cav1P49817 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cav1P49817 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cav1P49817 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cav1P49817 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cav1P49817 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cav1P49817 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cav1P49817 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cav1P49817 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cav1P49817 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cav1P49817 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Cav1P49817 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cav1P49817 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Cav1P49817 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cav1P49817 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cav1P49817 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cav1P49817 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms