Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms