Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms