Protein–RNA interactions for Protein: P36536

Sar1a, GTP-binding protein SAR1a, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1aP36536 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sar1aP36536 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sar1aP36536 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sar1aP36536 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sar1aP36536 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sar1aP36536 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sar1aP36536 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sar1aP36536 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sar1aP36536 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sar1aP36536 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sar1aP36536 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sar1aP36536 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sar1aP36536 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Sar1aP36536 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sar1aP36536 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sar1aP36536 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sar1aP36536 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sar1aP36536 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sar1aP36536 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sar1aP36536 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sar1aP36536 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sar1aP36536 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sar1aP36536 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sar1aP36536 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sar1aP36536 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sar1aP36536 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sar1aP36536 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sar1aP36536 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sar1aP36536 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sar1aP36536 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sar1aP36536 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sar1aP36536 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sar1aP36536 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sar1aP36536 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sar1aP36536 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sar1aP36536 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sar1aP36536 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sar1aP36536 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sar1aP36536 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sar1aP36536 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sar1aP36536 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sar1aP36536 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sar1aP36536 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sar1aP36536 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sar1aP36536 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sar1aP36536 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sar1aP36536 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sar1aP36536 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sar1aP36536 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sar1aP36536 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sar1aP36536 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sar1aP36536 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sar1aP36536 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sar1aP36536 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sar1aP36536 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sar1aP36536 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sar1aP36536 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sar1aP36536 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sar1aP36536 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Sar1aP36536 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sar1aP36536 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sar1aP36536 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sar1aP36536 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Sar1aP36536 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sar1aP36536 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sar1aP36536 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sar1aP36536 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sar1aP36536 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sar1aP36536 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sar1aP36536 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sar1aP36536 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sar1aP36536 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sar1aP36536 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sar1aP36536 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sar1aP36536 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sar1aP36536 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sar1aP36536 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sar1aP36536 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sar1aP36536 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sar1aP36536 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sar1aP36536 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sar1aP36536 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sar1aP36536 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sar1aP36536 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sar1aP36536 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sar1aP36536 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sar1aP36536 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sar1aP36536 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms