Protein–RNA interactions for Protein: P28293

Ctsg, Cathepsin G, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsgP28293 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtsgP28293 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtsgP28293 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtsgP28293 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtsgP28293 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtsgP28293 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
CtsgP28293 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsgP28293 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsgP28293 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsgP28293 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsgP28293 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsgP28293 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsgP28293 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsgP28293 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsgP28293 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsgP28293 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsgP28293 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsgP28293 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsgP28293 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsgP28293 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsgP28293 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsgP28293 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsgP28293 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsgP28293 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsgP28293 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsgP28293 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsgP28293 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsgP28293 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsgP28293 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsgP28293 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsgP28293 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsgP28293 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsgP28293 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsgP28293 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsgP28293 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsgP28293 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsgP28293 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsgP28293 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsgP28293 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsgP28293 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsgP28293 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsgP28293 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsgP28293 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsgP28293 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsgP28293 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsgP28293 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsgP28293 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsgP28293 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsgP28293 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsgP28293 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsgP28293 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsgP28293 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsgP28293 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsgP28293 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsgP28293 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsgP28293 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsgP28293 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsgP28293 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsgP28293 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsgP28293 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsgP28293 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsgP28293 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsgP28293 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsgP28293 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsgP28293 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsgP28293 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsgP28293 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsgP28293 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsgP28293 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsgP28293 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsgP28293 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsgP28293 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsgP28293 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsgP28293 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsgP28293 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsgP28293 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtsgP28293 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtsgP28293 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtsgP28293 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtsgP28293 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtsgP28293 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtsgP28293 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtsgP28293 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtsgP28293 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtsgP28293 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtsgP28293 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtsgP28293 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtsgP28293 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtsgP28293 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtsgP28293 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtsgP28293 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtsgP28293 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtsgP28293 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtsgP28293 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtsgP28293 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CtsgP28293 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtsgP28293 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtsgP28293 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtsgP28293 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtsgP28293 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms